More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4273 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  50.84 
 
 		 660 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  67.57 
 
 		 667 aa  913    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  66.72 
 
 		 669 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  67.38 
 
 		 663 aa  889    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  50.69 
 
 		 660 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  62.84 
 
 		 666 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  55.67 
 
 		 670 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  100 
 
 		 673 aa  1375    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  73.17 
 
 		 663 aa  1014    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  63.08 
 
 		 650 aa  805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  66.67 
 
 		 542 aa  727    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  50.84 
 
 		 660 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  50.84 
 
 		 660 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  51.61 
 
 		 646 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  55.21 
 
 		 648 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  57.73 
 
 		 667 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  55.96 
 
 		 663 aa  727    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  56.41 
 
 		 633 aa  700    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  56.9 
 
 		 524 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  55.6 
 
 		 526 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  55.6 
 
 		 526 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  54.42 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  52.56 
 
 		 529 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  54.1 
 
 		 522 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  51.13 
 
 		 521 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  44.9 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  54.4 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  45.25 
 
 		 547 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  43.74 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  45.33 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  46.55 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  46.77 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  46.98 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  43.23 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  46.55 
 
 		 531 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  46.34 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  43.05 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  43.05 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  46.55 
 
 		 531 aa  432  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  46.55 
 
 		 531 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  46.55 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  46.34 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  44.25 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  43.05 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  45.76 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  43.48 
 
 		 523 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  46.49 
 
 		 520 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  44.6 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  44.84 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  42.55 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  43.69 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  45.01 
 
 		 509 aa  382  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  41.64 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  44.07 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  40.22 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  43.88 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  43.71 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  43.5 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  43.71 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  39.2 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  39.19 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  39.56 
 
 		 544 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  38.93 
 
 		 522 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  40.6 
 
 		 522 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  40.04 
 
 		 533 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.94 
 
 		 531 aa  354  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  40.63 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  39.15 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  40.04 
 
 		 526 aa  347  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  41.26 
 
 		 539 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  40.2 
 
 		 523 aa  334  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  41.58 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  38.61 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  38.61 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  40.22 
 
 		 543 aa  316  9e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.56 
 
 		 508 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  37.7 
 
 		 543 aa  310  5e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.84 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.95 
 
 		 453 aa  104  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27.9 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  26.4 
 
 		 505 aa  97.4  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.6 
 
 		 463 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.56 
 
 		 217 aa  87.4  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.7 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  27.02 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.3 
 
 		 217 aa  82.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  26.47 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  32.6 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  25.24 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.64 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.85 
 
 		 217 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.92 
 
 		 236 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.87 
 
 		 218 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.96 
 
 		 235 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.41 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  27.41 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.41 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.41 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  27.41 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.89 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>