More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1897 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  98.49 
 
 		 531 aa  1070    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  98.87 
 
 		 531 aa  1072    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  92.28 
 
 		 531 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  98.68 
 
 		 531 aa  1071    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  99.44 
 
 		 531 aa  1078    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  92.47 
 
 		 531 aa  1022    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  98.31 
 
 		 531 aa  1069    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  99.25 
 
 		 531 aa  1075    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  92.28 
 
 		 531 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  98.49 
 
 		 531 aa  1070    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  100 
 
 		 531 aa  1085    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  92.28 
 
 		 531 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  92.09 
 
 		 531 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  88.85 
 
 		 531 aa  987    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  44.85 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  45.95 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  45.19 
 
 		 666 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  43.85 
 
 		 542 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  44.57 
 
 		 663 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  45.72 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  45.25 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  44.91 
 
 		 663 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  42.94 
 
 		 646 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  46.44 
 
 		 673 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  43.8 
 
 		 529 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  43.47 
 
 		 660 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  43.32 
 
 		 650 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  43.66 
 
 		 660 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  44.97 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  43.47 
 
 		 660 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  44.1 
 
 		 663 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  42.69 
 
 		 660 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  41.88 
 
 		 648 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  43.44 
 
 		 667 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  40.43 
 
 		 521 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  41.12 
 
 		 526 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  41.29 
 
 		 670 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  42.29 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  41.81 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  41.94 
 
 		 633 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  41.7 
 
 		 526 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  41.7 
 
 		 526 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  38.48 
 
 		 532 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.48 
 
 		 531 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  38.94 
 
 		 533 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  39.32 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  37.69 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  37.12 
 
 		 542 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  38.18 
 
 		 520 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  38.93 
 
 		 539 aa  349  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  37.88 
 
 		 539 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  37.83 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  38.78 
 
 		 537 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  37.4 
 
 		 513 aa  343  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  37.8 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  38.79 
 
 		 522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  42.68 
 
 		 433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  37.24 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  37.6 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  36.98 
 
 		 554 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  37.4 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  37.4 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  37.4 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  36.86 
 
 		 547 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  36.79 
 
 		 553 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 522 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  37.13 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  38.27 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  38.1 
 
 		 544 aa  322  8e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  36.67 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  36.35 
 
 		 530 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  37.3 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  34.67 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  35.89 
 
 		 508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.08 
 
 		 543 aa  280  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 520 aa  280  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 520 aa  280  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.45 
 
 		 561 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.81 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.66 
 
 		 453 aa  93.2  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  23.93 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.8 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  24.69 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.69 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  24.69 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.69 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.69 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.22 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.66 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  23.89 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.08 
 
 		 217 aa  72  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  27.62 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.72 
 
 		 269 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.14 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.87 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  26.22 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  23.02 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.73 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>