More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1437 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  99.55 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  99.09 
 
 
220 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  60.55 
 
 
218 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  60.09 
 
 
218 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.68 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  54.42 
 
 
218 aa  248  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.61 
 
 
217 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.87 
 
 
217 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.92 
 
 
218 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.03 
 
 
215 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  53 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.27 
 
 
220 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.8 
 
 
216 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  55.76 
 
 
217 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  55.05 
 
 
200 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.94 
 
 
217 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.61 
 
 
218 aa  218  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  52.09 
 
 
218 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  51.89 
 
 
214 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  49.3 
 
 
232 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.29 
 
 
237 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.77 
 
 
245 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.77 
 
 
245 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.28 
 
 
255 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.13 
 
 
232 aa  204  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.37 
 
 
225 aa  204  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.79 
 
 
246 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  47.57 
 
 
237 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  49.3 
 
 
232 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  49.07 
 
 
232 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.6 
 
 
237 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  48.6 
 
 
232 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.81 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.95 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.29 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.6 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.04 
 
 
245 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.95 
 
 
233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.54 
 
 
272 aa  197  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.12 
 
 
244 aa  197  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.79 
 
 
234 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.79 
 
 
234 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  45.79 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.91 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.5 
 
 
229 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.15 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  45.37 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.8 
 
 
238 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  45.33 
 
 
237 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  44.86 
 
 
237 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
237 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.89 
 
 
234 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.53 
 
 
463 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  45.54 
 
 
329 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  45.59 
 
 
302 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.31 
 
 
238 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.88 
 
 
237 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
234 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
229 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
234 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.79 
 
 
235 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
238 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.1 
 
 
231 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.86 
 
 
238 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1374  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 
221 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
238 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.54 
 
 
219 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  45.32 
 
 
242 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.54 
 
 
238 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  44.61 
 
 
231 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
238 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.61 
 
 
231 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
238 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46 
 
 
235 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.93 
 
 
237 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.93 
 
 
282 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  43.93 
 
 
237 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.5 
 
 
236 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.93 
 
 
282 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  45.28 
 
 
226 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  43.93 
 
 
282 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.93 
 
 
282 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.55 
 
 
238 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  45.1 
 
 
234 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>