More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0868 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.69 
 
 
218 aa  304  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  67.44 
 
 
215 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.44 
 
 
220 aa  268  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  62.44 
 
 
220 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  59.62 
 
 
220 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  61.5 
 
 
217 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  57.44 
 
 
200 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  54.98 
 
 
217 aa  228  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
217 aa  227  9e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.09 
 
 
217 aa  218  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  52.55 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  52.04 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.27 
 
 
225 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  44.6 
 
 
220 aa  201  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  44.6 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.6 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  44.6 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  44.6 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.17 
 
 
218 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  44.6 
 
 
220 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  45.75 
 
 
218 aa  197  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  45.02 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.9 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
233 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  41.67 
 
 
242 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  45.93 
 
 
218 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.33 
 
 
238 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.64 
 
 
255 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43 
 
 
235 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.23 
 
 
244 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  42.86 
 
 
238 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  40.69 
 
 
245 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.64 
 
 
238 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.23 
 
 
234 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.23 
 
 
234 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.17 
 
 
232 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.64 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  43.75 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.62 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  42.5 
 
 
329 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.78 
 
 
235 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  43.75 
 
 
234 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.62 
 
 
245 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.62 
 
 
245 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.1 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.17 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  43.69 
 
 
232 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.13 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.35 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.67 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.23 
 
 
229 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.33 
 
 
221 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.19 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.35 
 
 
229 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
282 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  40 
 
 
282 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  40 
 
 
237 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  40 
 
 
282 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  40 
 
 
237 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  40 
 
 
282 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.31 
 
 
234 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
282 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.94 
 
 
242 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  40.48 
 
 
237 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.78 
 
 
235 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  39.34 
 
 
232 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.9 
 
 
235 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.95 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
237 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  44.17 
 
 
232 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.65 
 
 
254 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  40.38 
 
 
253 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  44.17 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  44.17 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  44.17 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  44.17 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  44.17 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  39.52 
 
 
237 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  43.22 
 
 
244 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.87 
 
 
267 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  40 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.38 
 
 
235 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.23 
 
 
235 aa  158  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
238 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40 
 
 
238 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  43.2 
 
 
232 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.92 
 
 
219 aa  157  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.71 
 
 
235 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.38 
 
 
272 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.78 
 
 
225 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>