More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2277 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
218 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  78.87 
 
 
215 aa  347  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  68.69 
 
 
215 aa  304  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  68.08 
 
 
220 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  64.79 
 
 
220 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  66.03 
 
 
220 aa  276  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.43 
 
 
217 aa  263  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  62.44 
 
 
217 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.08 
 
 
200 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  58.88 
 
 
217 aa  250  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.74 
 
 
217 aa  247  8e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.92 
 
 
220 aa  241  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  55.92 
 
 
220 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.92 
 
 
220 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.92 
 
 
220 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  55.92 
 
 
220 aa  239  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.92 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  54.72 
 
 
218 aa  234  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  54.72 
 
 
218 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  52.4 
 
 
218 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.46 
 
 
225 aa  217  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.8 
 
 
218 aa  215  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  52.88 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  51.18 
 
 
214 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.48 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.7 
 
 
233 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.23 
 
 
216 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  47.83 
 
 
232 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.4 
 
 
237 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.4 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  43.4 
 
 
237 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  43.4 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.4 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.4 
 
 
282 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  43.87 
 
 
237 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.7 
 
 
234 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.7 
 
 
234 aa  185  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.81 
 
 
233 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.29 
 
 
229 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.4 
 
 
237 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  44.81 
 
 
233 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  42.92 
 
 
282 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.4 
 
 
237 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.34 
 
 
232 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  44.24 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.93 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.24 
 
 
234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.86 
 
 
232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.4 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.15 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.4 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.4 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.87 
 
 
238 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.87 
 
 
238 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  46 
 
 
244 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.78 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.23 
 
 
235 aa  181  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  43.96 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  48.31 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  47.83 
 
 
232 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.78 
 
 
234 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
245 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  42.72 
 
 
253 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  43 
 
 
242 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.5 
 
 
238 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.7 
 
 
254 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
245 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  47.34 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.5 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.94 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.59 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  42.29 
 
 
235 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45 
 
 
267 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.09 
 
 
254 aa  178  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.69 
 
 
234 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.57 
 
 
234 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.86 
 
 
234 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.86 
 
 
234 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.86 
 
 
234 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2076  3-oxoacid CoA-transferase  42.72 
 
 
232 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.86 
 
 
234 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.99 
 
 
231 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  42.52 
 
 
231 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.52 
 
 
231 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.98 
 
 
235 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
235 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.46 
 
 
242 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.43 
 
 
255 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  42.93 
 
 
329 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.23 
 
 
233 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.42 
 
 
238 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  43.9 
 
 
237 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1357  3-oxoacid CoA-transferase  45.15 
 
 
233 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.17 
 
 
235 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>