More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1075 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  65.09 
 
 
217 aa  285  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.67 
 
 
217 aa  259  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.78 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.61 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  51.61 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.61 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  51.61 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.61 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.61 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.58 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  55.09 
 
 
218 aa  241  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.8 
 
 
218 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.89 
 
 
215 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  50.23 
 
 
220 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.17 
 
 
215 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.42 
 
 
218 aa  222  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.42 
 
 
218 aa  221  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
217 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  55.9 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  56.28 
 
 
218 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  51.64 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.28 
 
 
225 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.33 
 
 
235 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.58 
 
 
272 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  48.08 
 
 
244 aa  195  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  45.41 
 
 
232 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47 
 
 
237 aa  194  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  51.18 
 
 
214 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  50.97 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.49 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 
270 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.05 
 
 
233 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  46.08 
 
 
237 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  44.5 
 
 
233 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  50.49 
 
 
232 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.25 
 
 
229 aa  187  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  50 
 
 
232 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.12 
 
 
233 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  44.6 
 
 
463 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.07 
 
 
229 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  44.84 
 
 
234 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.5 
 
 
238 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.84 
 
 
234 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  49.03 
 
 
232 aa  184  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.16 
 
 
242 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.54 
 
 
232 aa  184  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.86 
 
 
234 aa  184  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
233 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.5 
 
 
235 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.5 
 
 
235 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  43.95 
 
 
302 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.5 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.7 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  43.06 
 
 
448 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.59 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.19 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.05 
 
 
236 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.58 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.78 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45 
 
 
238 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.28 
 
 
240 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.58 
 
 
245 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.58 
 
 
245 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.02 
 
 
236 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  43.78 
 
 
253 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.6 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.2 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.86 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  43.78 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  43.05 
 
 
234 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.72 
 
 
244 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.93 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  42.65 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.05 
 
 
234 aa  177  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17570  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.54 
 
 
232 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.95 
 
 
232 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.75 
 
 
233 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.75 
 
 
233 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.78 
 
 
254 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
237 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  44.16 
 
 
235 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  40.93 
 
 
329 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.78 
 
 
235 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.75 
 
 
234 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.75 
 
 
234 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  44.23 
 
 
235 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>