More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1472 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  70.45 
 
 
220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  68.18 
 
 
220 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  66.67 
 
 
217 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  66.03 
 
 
218 aa  276  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  66 
 
 
200 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  64.08 
 
 
217 aa  264  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  63.21 
 
 
215 aa  261  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  59.62 
 
 
215 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.92 
 
 
217 aa  250  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  57.62 
 
 
225 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.24 
 
 
217 aa  234  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  53 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  53 
 
 
220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  53 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  53 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  53 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.98 
 
 
218 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  51.61 
 
 
218 aa  222  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  51.49 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 
218 aa  203  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  52.07 
 
 
218 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  51.17 
 
 
214 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.13 
 
 
216 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.7 
 
 
228 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  45.02 
 
 
448 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.93 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  45.93 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.81 
 
 
230 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  45.45 
 
 
282 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  45.45 
 
 
282 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
231 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  45.45 
 
 
282 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  45.45 
 
 
282 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  44.29 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  45.45 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.66 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.29 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.93 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  45.45 
 
 
237 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  45.45 
 
 
237 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.79 
 
 
235 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.42 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1076  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.39 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  44.98 
 
 
282 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.98 
 
 
237 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  44.98 
 
 
237 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.98 
 
 
235 aa  177  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1120  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.93 
 
 
225 aa  177  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.72 
 
 
233 aa  177  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.5 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.81 
 
 
231 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.77 
 
 
230 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.41 
 
 
235 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  46.38 
 
 
235 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.38 
 
 
229 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.05 
 
 
235 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
231 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.44 
 
 
231 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  46.38 
 
 
235 aa  174  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.47 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.6 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.6 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.34 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  45.45 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.56 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.5 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  46.31 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43 
 
 
272 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.78 
 
 
219 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.43 
 
 
255 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.43 
 
 
246 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  43.26 
 
 
238 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  41.67 
 
 
232 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4435  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.81 
 
 
233 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.5 
 
 
237 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1374  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.45 
 
 
221 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  40.48 
 
 
253 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.47 
 
 
267 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
219 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.9 
 
 
233 aa  168  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.55 
 
 
220 aa  168  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  40.93 
 
 
242 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.86 
 
 
233 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.23 
 
 
240 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  42.79 
 
 
238 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.99 
 
 
233 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  40.81 
 
 
235 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.43 
 
 
234 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.43 
 
 
234 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  42.4 
 
 
276 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47 
 
 
221 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  42 
 
 
237 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.93 
 
 
238 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>