More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2290 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.67 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.24 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.43 
 
 
236 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  51.24 
 
 
302 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  53.23 
 
 
244 aa  207  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.25 
 
 
245 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  51.24 
 
 
237 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.25 
 
 
245 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  49.76 
 
 
232 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
235 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.25 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.72 
 
 
229 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  48.33 
 
 
253 aa  205  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  50.75 
 
 
329 aa  204  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.29 
 
 
237 aa  204  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50 
 
 
229 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  49.75 
 
 
235 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.37 
 
 
233 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.5 
 
 
244 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  48.34 
 
 
233 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.24 
 
 
235 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4553  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.47 
 
 
254 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.51 
 
 
234 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.01 
 
 
245 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  50.25 
 
 
236 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.58 
 
 
272 aa  201  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  50.75 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.14 
 
 
225 aa  201  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  50.75 
 
 
234 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  48.51 
 
 
242 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
276 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  48.33 
 
 
448 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.52 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.26 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.25 
 
 
233 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.26 
 
 
238 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1563  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.75 
 
 
234 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.76 
 
 
233 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.74 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.23 
 
 
219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.6 
 
 
233 aa  198  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.52 
 
 
238 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.02 
 
 
245 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.75 
 
 
234 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  49.53 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.75 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.83 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1505  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.17 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571069  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  49.53 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  48.36 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  49.53 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.75 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.12 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.48 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
230 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.77 
 
 
228 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  50 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  49.3 
 
 
238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.3 
 
 
238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.3 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.3 
 
 
238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0351  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.71 
 
 
236 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.901849  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.25 
 
 
235 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.45 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2761  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.31 
 
 
234 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.47 
 
 
231 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.46 
 
 
243 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50 
 
 
242 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.26 
 
 
233 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1706  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.74 
 
 
233 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.58 
 
 
237 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4610  3-oxoacid CoA-transferase  48.26 
 
 
234 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000693974  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.75 
 
 
242 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.28 
 
 
234 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.75 
 
 
237 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.11 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  46.7 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.01 
 
 
246 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  45.54 
 
 
220 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.54 
 
 
220 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  50.48 
 
 
229 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.76 
 
 
267 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  48.58 
 
 
237 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.5 
 
 
238 aa  192  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  45.54 
 
 
220 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  45.54 
 
 
220 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.7 
 
 
235 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>