More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1374 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1374  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
221 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  65.42 
 
 
216 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  49.55 
 
 
220 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.55 
 
 
220 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  49.55 
 
 
220 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  49.55 
 
 
220 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  49.55 
 
 
220 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  49.55 
 
 
220 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  51.26 
 
 
200 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.51 
 
 
220 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.57 
 
 
218 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.31 
 
 
217 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47 
 
 
220 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  45.45 
 
 
220 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.27 
 
 
244 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.93 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  43.27 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.93 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  48.73 
 
 
218 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  48.22 
 
 
218 aa  181  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.85 
 
 
215 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.93 
 
 
234 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.73 
 
 
245 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.4 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.4 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.95 
 
 
267 aa  177  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.79 
 
 
237 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  48.54 
 
 
214 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.69 
 
 
246 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.33 
 
 
235 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.99 
 
 
245 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.09 
 
 
255 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.14 
 
 
231 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  42.65 
 
 
231 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.65 
 
 
231 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5289  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.16 
 
 
231 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  41.4 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  42.51 
 
 
463 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.17 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.15 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.75 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.79 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  44.76 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.23 
 
 
244 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.43 
 
 
229 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.29 
 
 
272 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.9 
 
 
233 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.18 
 
 
230 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.23 
 
 
233 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.57 
 
 
235 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.65 
 
 
246 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
232 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.41 
 
 
270 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  41.79 
 
 
237 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.94 
 
 
236 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  40 
 
 
253 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.28 
 
 
237 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.23 
 
 
233 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  42.79 
 
 
233 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.23 
 
 
235 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.55 
 
 
237 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  39.53 
 
 
233 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.19 
 
 
233 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.78 
 
 
238 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.28 
 
 
233 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  45.24 
 
 
232 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.24 
 
 
232 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  45.24 
 
 
232 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  45.24 
 
 
232 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  45.24 
 
 
232 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  45.24 
 
 
232 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  45.24 
 
 
232 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  39.81 
 
 
238 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  44.76 
 
 
232 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  41.29 
 
 
242 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  40.09 
 
 
235 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.55 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.06 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  41.55 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  41.26 
 
 
237 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.06 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.38 
 
 
219 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.55 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  39.61 
 
 
329 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4164  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.07 
 
 
235 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  44.29 
 
 
232 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1163  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  38.36 
 
 
235 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  40.58 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  39.81 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.78 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  40.78 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5585  coenzyme A transferase  41.35 
 
 
246 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  41.79 
 
 
244 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  42.58 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  39.81 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  41.92 
 
 
302 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0572  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.28 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0035741  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  41.86 
 
 
233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  41.55 
 
 
282 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>