More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2370 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  100 
 
 
220 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  99.09 
 
 
220 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  99.09 
 
 
220 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  99.09 
 
 
220 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  99.09 
 
 
220 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  98.64 
 
 
220 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  61.01 
 
 
218 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  60.55 
 
 
218 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.68 
 
 
220 aa  251  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  53.95 
 
 
218 aa  246  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.87 
 
 
217 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  52.61 
 
 
217 aa  240  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.92 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  53.52 
 
 
215 aa  237  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  53 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.56 
 
 
216 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  53.27 
 
 
220 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  55.76 
 
 
217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  54.55 
 
 
200 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.96 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.61 
 
 
218 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  51.89 
 
 
214 aa  208  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  51.63 
 
 
218 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  48.84 
 
 
232 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.8 
 
 
237 aa  205  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.28 
 
 
245 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  47.09 
 
 
237 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.28 
 
 
245 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.53 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.78 
 
 
255 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.66 
 
 
232 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  48.84 
 
 
232 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.08 
 
 
246 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.91 
 
 
225 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  49.07 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  49.07 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  49.07 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  49.07 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  49.07 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  48.6 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.13 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.6 
 
 
215 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  48.13 
 
 
232 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.32 
 
 
235 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.49 
 
 
251 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.95 
 
 
233 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.32 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.79 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.8 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.79 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.63 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  45.37 
 
 
232 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  45.79 
 
 
234 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.05 
 
 
272 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.91 
 
 
244 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.5 
 
 
245 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.5 
 
 
229 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.15 
 
 
234 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  44.86 
 
 
237 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.31 
 
 
238 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.86 
 
 
234 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.27 
 
 
229 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
237 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  44.86 
 
 
237 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.19 
 
 
234 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.07 
 
 
219 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1374  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.55 
 
 
221 aa  191  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.44 
 
 
234 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.5 
 
 
236 aa  191  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
234 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.53 
 
 
463 aa  191  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  45.05 
 
 
329 aa  191  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  45.1 
 
 
302 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
237 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.81 
 
 
238 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.05 
 
 
238 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.33 
 
 
235 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1871  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.88 
 
 
231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
238 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  44.39 
 
 
231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3593  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310124  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3158  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.93 
 
 
238 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  44.39 
 
 
238 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  44.83 
 
 
242 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5017  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.93 
 
 
238 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.39 
 
 
238 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.91 
 
 
221 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  43.46 
 
 
282 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.46 
 
 
282 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  43.46 
 
 
282 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  44.61 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.12 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.61 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  44.61 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.06 
 
 
238 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.5 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>