More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0212 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  100 
 
 
217 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.58 
 
 
217 aa  321  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.74 
 
 
218 aa  267  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  61.61 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  59.53 
 
 
215 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  60.19 
 
 
220 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  55.87 
 
 
220 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  55.87 
 
 
220 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.87 
 
 
220 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.87 
 
 
220 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  55.87 
 
 
220 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  55.87 
 
 
220 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  62.67 
 
 
218 aa  257  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  59.24 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  56.67 
 
 
218 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  58.49 
 
 
218 aa  246  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  56.19 
 
 
218 aa  245  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  63.21 
 
 
200 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.87 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0868  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  52.09 
 
 
215 aa  238  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  56.87 
 
 
217 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  56.87 
 
 
214 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2248  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  55.45 
 
 
218 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  49.76 
 
 
225 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2329  acetate CoA-transferase, subunit A  51.46 
 
 
232 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3296  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  47.22 
 
 
229 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  47.14 
 
 
253 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  48.26 
 
 
237 aa  202  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  50.49 
 
 
232 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.203054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  51.46 
 
 
232 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  48.76 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  47.76 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.02 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  50.97 
 
 
232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2140  acetate CoA-transferase subunit A  50.97 
 
 
232 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2078  aetate CoA-transferase, alpha subunit  50.97 
 
 
232 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2074  aetate CoA-transferase, alpha subunit  50.97 
 
 
232 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2295  acetate CoA-transferase subunit A  50.97 
 
 
232 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2320  acetate CoA-transferase, subunit A  50.97 
 
 
232 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  50.49 
 
 
232 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.87 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.48 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3047  acetate CoA-transferase, subunit A  50 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  48.26 
 
 
244 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.57 
 
 
272 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.32 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.03 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.77 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.12 
 
 
234 aa  194  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  46.27 
 
 
233 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  46.45 
 
 
448 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6830  acetyl-CoA/acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  46.34 
 
 
242 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.261495  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46 
 
 
235 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
244 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.76 
 
 
245 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1246  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.77 
 
 
235 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.76 
 
 
245 aa  191  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.5 
 
 
238 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.81 
 
 
238 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2833  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2978  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1434  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  45.59 
 
 
238 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.77 
 
 
255 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  44.76 
 
 
234 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.27 
 
 
233 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46 
 
 
244 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.67 
 
 
225 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.76 
 
 
234 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  43.75 
 
 
237 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.13 
 
 
232 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.29 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.24 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.57 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.81 
 
 
233 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  46.77 
 
 
242 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1670  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  43.13 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.835044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  45.77 
 
 
234 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.98 
 
 
235 aa  187  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.77 
 
 
234 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.24 
 
 
267 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  46.97 
 
 
236 aa  187  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3122  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  45.75 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.408127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2735  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.75 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  44.28 
 
 
302 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.75 
 
 
232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  43.4 
 
 
239 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1010  coenzyme A transferase  44.61 
 
 
329 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.436488  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  44.28 
 
 
233 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01941  putative succinyl-CoA transferase, alpha subunit  43.81 
 
 
235 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  45.27 
 
 
245 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  44.67 
 
 
463 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>