More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1948 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  99.25 
 
 		 531 aa  1078    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  100 
 
 		 531 aa  1083    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  99.06 
 
 		 531 aa  1078    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  99.44 
 
 		 531 aa  1080    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  92.84 
 
 		 531 aa  1027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  93.03 
 
 		 531 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  92.84 
 
 		 531 aa  1027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  99.25 
 
 		 531 aa  1078    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  98.68 
 
 		 531 aa  1070    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  98.87 
 
 		 531 aa  1072    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  92.66 
 
 		 531 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  92.84 
 
 		 531 aa  1027    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  99.25 
 
 		 531 aa  1077    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  89.22 
 
 		 531 aa  992    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  45.04 
 
 		 667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  46.14 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  45.38 
 
 		 666 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  44.23 
 
 		 542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  44.77 
 
 		 663 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  45.72 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  45.11 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  46.65 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  44.87 
 
 		 669 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  43.51 
 
 		 650 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  43.6 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  44.29 
 
 		 663 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  43.47 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  43.47 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  43.66 
 
 		 660 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  42.94 
 
 		 646 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  44.97 
 
 		 522 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  42.69 
 
 		 660 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  42.07 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  43.84 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  41.31 
 
 		 526 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  41.68 
 
 		 670 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  40.43 
 
 		 521 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  42.29 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  42.14 
 
 		 633 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  41.9 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  41.9 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  41.81 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  38.86 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.67 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  39.89 
 
 		 533 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  39.13 
 
 		 533 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 542 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  39.12 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  37.99 
 
 		 513 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  38.97 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  38.07 
 
 		 539 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  38.02 
 
 		 532 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  38.39 
 
 		 513 aa  346  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  39.19 
 
 		 522 aa  346  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  37.98 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  37.8 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  38.19 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  37.34 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  37.99 
 
 		 513 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  37.99 
 
 		 513 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  42.93 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  37.99 
 
 		 513 aa  339  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.16 
 
 		 553 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  37.04 
 
 		 547 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  37.69 
 
 		 522 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  37.33 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  38.65 
 
 		 543 aa  329  7e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  37.99 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  36.86 
 
 		 526 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  36.92 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  37.7 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  35.25 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  36.28 
 
 		 508 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.08 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.8 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  27.2 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.94 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.66 
 
 		 453 aa  93.6  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  24.08 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.8 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  24.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  24.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  24.29 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.85 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.03 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.6 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  23.89 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  25.96 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  23.21 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.72 
 
 		 269 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.14 
 
 		 272 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.87 
 
 		 218 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.89 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.5 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>