More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3570 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  67.61 
 
 
533 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  63.5 
 
 
531 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  100 
 
 
532 aa  1076    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  66.86 
 
 
533 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  67.05 
 
 
539 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  64.88 
 
 
523 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  65.78 
 
 
539 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  63.55 
 
 
542 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  66.16 
 
 
537 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  55.56 
 
 
544 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  42.94 
 
 
522 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  43.07 
 
 
650 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  42.25 
 
 
521 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  40.76 
 
 
542 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  42.61 
 
 
663 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  40.68 
 
 
667 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  41.03 
 
 
660 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  41.03 
 
 
660 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  41.03 
 
 
660 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  40.49 
 
 
666 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  40.84 
 
 
660 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  40.76 
 
 
670 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  41.41 
 
 
663 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  40.12 
 
 
516 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  40.04 
 
 
526 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  40.04 
 
 
526 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  39.73 
 
 
646 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  41.32 
 
 
669 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  39.81 
 
 
532 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  39.07 
 
 
673 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  40.95 
 
 
667 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  38.13 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  39.85 
 
 
663 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  40.57 
 
 
530 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  40.11 
 
 
633 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.5 
 
 
522 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  38.62 
 
 
529 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  40 
 
 
527 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  38.21 
 
 
531 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.31 
 
 
526 aa  349  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  39.16 
 
 
522 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  38.21 
 
 
531 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  37.83 
 
 
531 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  38.21 
 
 
531 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  37.83 
 
 
531 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  38.02 
 
 
531 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  38.02 
 
 
531 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  39.21 
 
 
526 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.83 
 
 
531 aa  346  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  38.4 
 
 
531 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  38.4 
 
 
531 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  38.4 
 
 
531 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  38.4 
 
 
531 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.59 
 
 
531 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  38.21 
 
 
531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.46 
 
 
523 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  39.69 
 
 
648 aa  340  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.23 
 
 
508 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.92 
 
 
509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  39.88 
 
 
520 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  36.87 
 
 
547 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  38.73 
 
 
557 aa  295  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  38.22 
 
 
433 aa  293  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  35.37 
 
 
554 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  34.74 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  37.16 
 
 
513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  36.03 
 
 
554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  37.36 
 
 
513 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  37.36 
 
 
513 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  37.36 
 
 
513 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  37.16 
 
 
513 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  37.16 
 
 
513 aa  269  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  35.63 
 
 
544 aa  269  8.999999999999999e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  32.06 
 
 
520 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  32.06 
 
 
520 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.14 
 
 
543 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  35.63 
 
 
543 aa  252  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.61 
 
 
453 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  24.6 
 
 
448 aa  90.1  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.52 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.71 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.77 
 
 
225 aa  82  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.96 
 
 
505 aa  80.5  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  28.62 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.32 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.31 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  25.5 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  25.5 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.5 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.5 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.1 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.97 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.1 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.19 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.19 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>