More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2224 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  66.6 
 
 		 533 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  66.6 
 
 		 533 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  68.93 
 
 		 539 aa  748    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  100 
 
 		 531 aa  1082    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  67.49 
 
 		 539 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  68.05 
 
 		 537 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  63.5 
 
 		 532 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  58.45 
 
 		 523 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  57.82 
 
 		 542 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  57.34 
 
 		 544 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  42.08 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  38.76 
 
 		 666 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  38.77 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  38.52 
 
 		 667 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  37.86 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  37.67 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.67 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.67 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.67 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  38.18 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  37.48 
 
 		 531 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  37.28 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.09 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  38.77 
 
 		 663 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  37.95 
 
 		 650 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  37.48 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  37.48 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  37.48 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  37.48 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  37.28 
 
 		 531 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  38.87 
 
 		 516 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  37.94 
 
 		 673 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  37.64 
 
 		 663 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  38.93 
 
 		 532 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  37.07 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  37.22 
 
 		 669 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  35.73 
 
 		 531 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  39.58 
 
 		 667 aa  346  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  37.12 
 
 		 663 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  38.67 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  37.26 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  38.49 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  37.81 
 
 		 660 aa  339  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  38.12 
 
 		 660 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  37.62 
 
 		 660 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  37.9 
 
 		 527 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  37.64 
 
 		 646 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  37.36 
 
 		 660 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  36.88 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  36.88 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  38.52 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  37.43 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  37.79 
 
 		 633 aa  329  9e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  40.48 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  37.93 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  38.07 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.52 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  36.64 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  34.63 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  37.4 
 
 		 648 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  37.55 
 
 		 513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  37.55 
 
 		 513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  37.55 
 
 		 513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  37.36 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  37.36 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  34.77 
 
 		 547 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  36.05 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.2 
 
 		 543 aa  281  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  36.28 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  35.31 
 
 		 557 aa  279  9e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  33.99 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  34.49 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  35.14 
 
 		 543 aa  267  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  33.27 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  31.84 
 
 		 520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  31.84 
 
 		 520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.77 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.53 
 
 		 217 aa  87.8  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.4 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.71 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.06 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  24.3 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.65 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  21.98 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.8 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32 
 
 		 233 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  29.12 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.02 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.6 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.12 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.58 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  30 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.8 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.78 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.05 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  29.72 
 
 		 237 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.8 
 
 		 233 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.81 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>