180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0346 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  91.82 
 
 		 553 aa  989    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  75.69 
 
 		 547 aa  812    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  100 
 
 		 554 aa  1122    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  96.02 
 
 		 554 aa  1036    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  49.64 
 
 		 650 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  48.55 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  46.35 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  46.26 
 
 		 667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  46.88 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  45.68 
 
 		 666 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  45.96 
 
 		 526 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  45.96 
 
 		 526 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  44.42 
 
 		 673 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  45.03 
 
 		 663 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  46.53 
 
 		 667 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  44.83 
 
 		 669 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  47.63 
 
 		 633 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  43.27 
 
 		 529 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  43.36 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  44.63 
 
 		 670 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  46.7 
 
 		 648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  42.57 
 
 		 663 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  43.01 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  41.8 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  42.11 
 
 		 660 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  42.29 
 
 		 660 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  42.11 
 
 		 660 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  42.7 
 
 		 646 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  42.05 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  43.14 
 
 		 433 aa  365  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  38.46 
 
 		 527 aa  360  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  37.89 
 
 		 531 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  37.89 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  37.89 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  37.89 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  37.89 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.7 
 
 		 531 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  37.52 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  37.52 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.52 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.52 
 
 		 531 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.52 
 
 		 531 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  37.34 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  37.16 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  36.98 
 
 		 531 aa  339  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  40 
 
 		 557 aa  320  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.94 
 
 		 523 aa  319  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  38.36 
 
 		 526 aa  310  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  36.96 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.3 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  36.2 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  38.7 
 
 		 520 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  35.89 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  35.51 
 
 		 539 aa  290  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  34.96 
 
 		 544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  34.12 
 
 		 533 aa  287  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  35.44 
 
 		 537 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  36.26 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  35.03 
 
 		 533 aa  283  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  36.14 
 
 		 522 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  34.72 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  34.17 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  35.78 
 
 		 526 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  35.85 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  37.09 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  35.85 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  34.28 
 
 		 523 aa  273  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  35.66 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  35.66 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  35.66 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  33.81 
 
 		 530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  37.39 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  31.85 
 
 		 543 aa  246  9e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  31.78 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  32.8 
 
 		 543 aa  223  9e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  30.87 
 
 		 520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  30.87 
 
 		 520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.39 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  24.44 
 
 		 561 aa  87  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.32 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  24.63 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.81 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  24.68 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.91 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  27.8 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.95 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.64 
 
 		 234 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  26.89 
 
 		 251 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.11 
 
 		 222 aa  53.9  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.77 
 
 		 223 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.69 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  23.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.11 
 
 		 217 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  26.52 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  27.85 
 
 		 251 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.6 
 
 		 216 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  26.5 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  27.6 
 
 		 216 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.6 
 
 		 216 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.6 
 
 		 216 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>