More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1375 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1375  3-oxoacid CoA-transferase  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.375962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0638  3-oxoacid CoA-transferase  74.06 
 
 
213 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.23 
 
 
220 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.58 
 
 
218 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  46.48 
 
 
220 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  46.48 
 
 
220 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  46.48 
 
 
220 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  46.48 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.42 
 
 
214 aa  187  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  44.86 
 
 
519 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  46.01 
 
 
220 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  46.01 
 
 
220 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  46.01 
 
 
220 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  46.01 
 
 
220 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  44.13 
 
 
219 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  46.01 
 
 
220 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.07 
 
 
229 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.33 
 
 
216 aa  185  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  47.8 
 
 
218 aa  184  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  43.66 
 
 
219 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.98 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.54 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  43.87 
 
 
218 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.83 
 
 
215 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.13 
 
 
220 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.77 
 
 
224 aa  179  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.44 
 
 
219 aa  177  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.6 
 
 
208 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.63 
 
 
218 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  41.59 
 
 
505 aa  176  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.69 
 
 
209 aa  175  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.08 
 
 
214 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.78 
 
 
228 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  44.39 
 
 
511 aa  174  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  45.33 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  45.81 
 
 
453 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.89 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  44.95 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  43.46 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.83 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.13 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.22 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.22 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.72 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.72 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.11 
 
 
209 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  45.96 
 
 
448 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.5 
 
 
215 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  44.44 
 
 
209 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.98 
 
 
216 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.06 
 
 
215 aa  170  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.16 
 
 
208 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.73 
 
 
268 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.26 
 
 
222 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.92 
 
 
222 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.15 
 
 
215 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  47.94 
 
 
202 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.19 
 
 
215 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.19 
 
 
215 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  43 
 
 
213 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2363  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  42.72 
 
 
219 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0158273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.21 
 
 
229 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.72 
 
 
218 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.43 
 
 
236 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1501  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.72 
 
 
218 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  44.95 
 
 
209 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43 
 
 
213 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  39.72 
 
 
219 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.51 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  43 
 
 
213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  43 
 
 
213 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  43.43 
 
 
218 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.51 
 
 
213 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  41.63 
 
 
217 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  41.87 
 
 
208 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.79 
 
 
447 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.23 
 
 
255 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.5 
 
 
231 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  41.55 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.02 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.96 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.94 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.72 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.5 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  43.94 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  43.94 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  43.94 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  43.94 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>