296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5586 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  93.84 
 
 
215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.72 
 
 
219 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  80.86 
 
 
220 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80 
 
 
217 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.19 
 
 
219 aa  351  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.52 
 
 
218 aa  351  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  79.52 
 
 
218 aa  350  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  79.52 
 
 
218 aa  350  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.52 
 
 
218 aa  350  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.52 
 
 
218 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.47 
 
 
220 aa  349  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  79.25 
 
 
219 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.05 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.47 
 
 
220 aa  349  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  345  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  78.57 
 
 
218 aa  343  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.81 
 
 
220 aa  330  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  75.48 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  74.52 
 
 
213 aa  323  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.77 
 
 
212 aa  322  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.64 
 
 
213 aa  321  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.73 
 
 
226 aa  320  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  72.38 
 
 
213 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.86 
 
 
213 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.38 
 
 
213 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.12 
 
 
213 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.95 
 
 
217 aa  314  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.63 
 
 
214 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70 
 
 
213 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.23 
 
 
217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.23 
 
 
217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.27 
 
 
221 aa  296  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.31 
 
 
229 aa  293  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.35 
 
 
220 aa  291  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.37 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.03 
 
 
216 aa  279  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.45 
 
 
223 aa  278  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.5 
 
 
210 aa  275  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.72 
 
 
220 aa  275  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.02 
 
 
227 aa  270  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.24 
 
 
218 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  61.17 
 
 
236 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.77 
 
 
222 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.38 
 
 
231 aa  265  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  62.38 
 
 
233 aa  264  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.17 
 
 
222 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.04 
 
 
227 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  58.17 
 
 
255 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  55.56 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  56.52 
 
 
229 aa  250  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
227 aa  250  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.21 
 
 
223 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
229 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
229 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.07 
 
 
234 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.13 
 
 
219 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.03 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.03 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.48 
 
 
240 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.74 
 
 
209 aa  241  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
210 aa  235  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.56 
 
 
209 aa  234  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.31 
 
 
213 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.11 
 
 
209 aa  228  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.8 
 
 
213 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.43 
 
 
217 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.8 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
222 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
212 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  56.72 
 
 
231 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.44 
 
 
209 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.31 
 
 
213 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.3 
 
 
255 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.67 
 
 
220 aa  221  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.98 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>