295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1230 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  91.47 
 
 
213 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  85.31 
 
 
217 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  84.36 
 
 
214 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  83.81 
 
 
215 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.9 
 
 
217 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.43 
 
 
217 aa  361  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.52 
 
 
229 aa  359  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  70.67 
 
 
215 aa  316  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.12 
 
 
212 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.53 
 
 
220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.05 
 
 
212 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.71 
 
 
217 aa  307  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.71 
 
 
218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.23 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.23 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  69.23 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.23 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.23 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
220 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
220 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.79 
 
 
219 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  68.75 
 
 
218 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  68.27 
 
 
218 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.31 
 
 
219 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  67.31 
 
 
220 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
219 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  67.31 
 
 
213 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.31 
 
 
213 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.15 
 
 
213 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.33 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.82 
 
 
220 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.54 
 
 
220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  59.42 
 
 
221 aa  268  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.06 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.77 
 
 
217 aa  264  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.41 
 
 
210 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.9 
 
 
223 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.78 
 
 
227 aa  255  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.66 
 
 
216 aa  254  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.1 
 
 
231 aa  254  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.61 
 
 
218 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.91 
 
 
222 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.9 
 
 
227 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59 
 
 
219 aa  246  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  54.46 
 
 
233 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
222 aa  238  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  53.73 
 
 
236 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
229 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  53.92 
 
 
229 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
234 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  50.73 
 
 
255 aa  228  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
229 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  50.72 
 
 
229 aa  224  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.43 
 
 
223 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.14 
 
 
240 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.14 
 
 
240 aa  221  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.14 
 
 
240 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.14 
 
 
240 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.14 
 
 
240 aa  221  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.57 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.69 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  50.24 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  51.71 
 
 
231 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  49.28 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.79 
 
 
213 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  50.49 
 
 
209 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.5 
 
 
217 aa  207  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  48.79 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.79 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.79 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.82 
 
 
268 aa  205  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.2 
 
 
221 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.26 
 
 
210 aa  204  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.31 
 
 
213 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.31 
 
 
213 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.02 
 
 
236 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  50.25 
 
 
218 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.22 
 
 
220 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.79 
 
 
221 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.4 
 
 
255 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  51.52 
 
 
209 aa  201  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>