299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6798 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  94.27 
 
 
229 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  88.99 
 
 
229 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  88.11 
 
 
229 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  86.78 
 
 
229 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.78 
 
 
227 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.91 
 
 
223 aa  374  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57 
 
 
215 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.31 
 
 
221 aa  246  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.07 
 
 
212 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
226 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
220 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
220 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.52 
 
 
218 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  57 
 
 
213 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
213 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.07 
 
 
217 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
218 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  55.29 
 
 
220 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  55.56 
 
 
218 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.56 
 
 
213 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
213 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.59 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.59 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.39 
 
 
217 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.45 
 
 
220 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
214 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.62 
 
 
229 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.37 
 
 
217 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.62 
 
 
219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.62 
 
 
213 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.42 
 
 
222 aa  234  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.62 
 
 
219 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.11 
 
 
222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  51.39 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.83 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.07 
 
 
212 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  53.52 
 
 
236 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.17 
 
 
219 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.15 
 
 
213 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.43 
 
 
215 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
220 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.95 
 
 
217 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 
221 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.2 
 
 
221 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 
220 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.44 
 
 
255 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.15 
 
 
218 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.28 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
215 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.23 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  47.22 
 
 
218 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.75 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 
227 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.2 
 
 
214 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.66 
 
 
210 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.66 
 
 
217 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.62 
 
 
218 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.48 
 
 
268 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
222 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  50 
 
 
233 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.31 
 
 
218 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.46 
 
 
227 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.77 
 
 
213 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  50 
 
 
218 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.1 
 
 
211 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  48.78 
 
 
217 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.82 
 
 
224 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.38 
 
 
231 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
218 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.75 
 
 
220 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.26 
 
 
236 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.77 
 
 
213 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.89 
 
 
221 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  49.03 
 
 
209 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  48.53 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.17 
 
 
222 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.77 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.77 
 
 
213 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  47.37 
 
 
218 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  47.37 
 
 
218 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.85 
 
 
218 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.34 
 
 
218 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>