More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2253 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  90.91 
 
 
220 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  90.91 
 
 
220 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  83.96 
 
 
215 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.86 
 
 
212 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  76.56 
 
 
219 aa  337  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.56 
 
 
219 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  77.99 
 
 
218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.48 
 
 
220 aa  334  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.6 
 
 
219 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.51 
 
 
218 aa  332  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.56 
 
 
217 aa  331  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  76.08 
 
 
218 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  76.08 
 
 
218 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.08 
 
 
218 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.08 
 
 
218 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.08 
 
 
218 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.6 
 
 
218 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  73.58 
 
 
212 aa  321  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70 
 
 
213 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.81 
 
 
226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.63 
 
 
215 aa  305  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
213 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.05 
 
 
217 aa  304  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.81 
 
 
213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  69.52 
 
 
213 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.52 
 
 
213 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.31 
 
 
213 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
214 aa  298  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.19 
 
 
221 aa  297  7e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.42 
 
 
217 aa  292  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.27 
 
 
213 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.09 
 
 
217 aa  288  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.64 
 
 
229 aa  286  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.38 
 
 
220 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.27 
 
 
210 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.2 
 
 
220 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  65.4 
 
 
233 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.28 
 
 
218 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.36 
 
 
223 aa  272  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.15 
 
 
227 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.26 
 
 
222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.35 
 
 
231 aa  266  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  61.24 
 
 
236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.86 
 
 
227 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.38 
 
 
216 aa  263  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  57.41 
 
 
255 aa  261  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.55 
 
 
222 aa  255  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.72 
 
 
219 aa  248  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.32 
 
 
240 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.32 
 
 
240 aa  247  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.32 
 
 
240 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.32 
 
 
240 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.32 
 
 
240 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.82 
 
 
240 aa  245  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  56.25 
 
 
229 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  55.29 
 
 
229 aa  243  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.05 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.25 
 
 
229 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
223 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
234 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
229 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.25 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.28 
 
 
213 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.28 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.28 
 
 
213 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.8 
 
 
213 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.43 
 
 
217 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  55.83 
 
 
209 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.83 
 
 
213 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  56.19 
 
 
212 aa  227  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.59 
 
 
221 aa  227  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.31 
 
 
213 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.19 
 
 
212 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.67 
 
 
213 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.56 
 
 
209 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.55 
 
 
210 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  54.29 
 
 
231 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.25 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.25 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>