More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3592 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  100 
 
 
255 aa  530  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  72 
 
 
236 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.56 
 
 
220 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.11 
 
 
221 aa  271  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.35 
 
 
220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.35 
 
 
220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  57.41 
 
 
220 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.17 
 
 
212 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.51 
 
 
215 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.6 
 
 
218 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.6 
 
 
218 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
218 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
218 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
218 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
217 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
218 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
219 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.21 
 
 
219 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.52 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  56.04 
 
 
213 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
213 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.85 
 
 
213 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.44 
 
 
209 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
210 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.56 
 
 
213 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.05 
 
 
226 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.17 
 
 
229 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
213 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.08 
 
 
213 aa  244  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
223 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.17 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  52.56 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.77 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  53.02 
 
 
229 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.17 
 
 
217 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.17 
 
 
212 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  55.88 
 
 
209 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  54.93 
 
 
212 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.31 
 
 
213 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.85 
 
 
209 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.2 
 
 
220 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.34 
 
 
213 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.31 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.31 
 
 
213 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.81 
 
 
209 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.87 
 
 
227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.44 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.23 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.44 
 
 
229 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
209 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.5 
 
 
212 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.59 
 
 
218 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.14 
 
 
213 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.83 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.34 
 
 
213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.2 
 
 
214 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 
217 aa  234  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.66 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.66 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.39 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.55 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.29 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.68 
 
 
215 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.06 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  52.71 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
212 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.77 
 
 
212 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.9 
 
 
219 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.64 
 
 
229 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.64 
 
 
229 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.64 
 
 
229 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.33 
 
 
212 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.45 
 
 
213 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.96 
 
 
217 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.5 
 
 
211 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.12 
 
 
224 aa  228  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.73 
 
 
213 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.14 
 
 
216 aa  228  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.26 
 
 
210 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.77 
 
 
218 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>