298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3668 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  93.84 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  83.96 
 
 
220 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.6 
 
 
220 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.6 
 
 
220 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.3 
 
 
217 aa  350  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.36 
 
 
218 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.83 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  77.83 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.83 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.83 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.83 
 
 
218 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.3 
 
 
218 aa  347  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.26 
 
 
219 aa  346  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.99 
 
 
219 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.83 
 
 
218 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.99 
 
 
219 aa  344  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.24 
 
 
220 aa  333  9e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.06 
 
 
212 aa  333  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.41 
 
 
215 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.4 
 
 
217 aa  322  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.38 
 
 
213 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.91 
 
 
213 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.6 
 
 
213 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.67 
 
 
213 aa  316  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  72.12 
 
 
213 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.12 
 
 
213 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.15 
 
 
214 aa  315  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.95 
 
 
226 aa  314  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.19 
 
 
217 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.9 
 
 
217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.61 
 
 
229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.05 
 
 
213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.76 
 
 
220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.1 
 
 
221 aa  296  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.35 
 
 
217 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.33 
 
 
223 aa  289  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.42 
 
 
227 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.68 
 
 
220 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.63 
 
 
210 aa  278  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.14 
 
 
231 aa  275  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.79 
 
 
222 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.43 
 
 
218 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  62.91 
 
 
233 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.5 
 
 
216 aa  269  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  61.27 
 
 
236 aa  262  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  59.51 
 
 
255 aa  259  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  57.49 
 
 
229 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  57.97 
 
 
229 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.05 
 
 
227 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.84 
 
 
222 aa  258  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.97 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.94 
 
 
223 aa  252  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
234 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
229 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.97 
 
 
227 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.87 
 
 
219 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.22 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.03 
 
 
240 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.55 
 
 
213 aa  240  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.03 
 
 
240 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.03 
 
 
240 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.48 
 
 
240 aa  238  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.1 
 
 
222 aa  237  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.08 
 
 
213 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.28 
 
 
213 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.28 
 
 
209 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
213 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.46 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.6 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.41 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.19 
 
 
213 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.11 
 
 
209 aa  228  8e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  55.24 
 
 
231 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.72 
 
 
221 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.33 
 
 
209 aa  224  9e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.14 
 
 
209 aa  224  9e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.24 
 
 
212 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
220 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.07 
 
 
209 aa  221  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>