More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4026 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4621  3-oxoadipate CoA-transferase  81.3 
 
 
231 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  55.24 
 
 
215 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.72 
 
 
212 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.35 
 
 
217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.11 
 
 
219 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  54.29 
 
 
220 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.86 
 
 
220 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.86 
 
 
220 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  53.3 
 
 
233 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.56 
 
 
210 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.11 
 
 
226 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.22 
 
 
219 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.61 
 
 
212 aa  214  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.4 
 
 
213 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  51.67 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.2 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.85 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.59 
 
 
218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.59 
 
 
218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.59 
 
 
218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.59 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.59 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.71 
 
 
213 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.32 
 
 
222 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.59 
 
 
216 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.2 
 
 
214 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.2 
 
 
217 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.8 
 
 
209 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  47.37 
 
 
221 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.46 
 
 
213 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  56.91 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.91 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.5 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.64 
 
 
222 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.06 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.98 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55 
 
 
220 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.06 
 
 
218 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.06 
 
 
227 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  47.57 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.97 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.25 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.5 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.33 
 
 
227 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.37 
 
 
223 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.7 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  51.96 
 
 
236 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.03 
 
 
217 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.09 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.67 
 
 
217 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.15 
 
 
219 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  47.67 
 
 
255 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.72 
 
 
215 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.09 
 
 
218 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  46.6 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.12 
 
 
221 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  46.6 
 
 
218 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.63 
 
 
218 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  46.76 
 
 
218 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  46.12 
 
 
218 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.31 
 
 
220 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1077  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  44.95 
 
 
226 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135615  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  46.12 
 
 
218 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  43.12 
 
 
229 aa  184  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.55 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  45.59 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.63 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.83 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.26 
 
 
217 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  48.37 
 
 
218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.63 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.63 
 
 
219 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.99 
 
 
223 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  48.95 
 
 
218 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.15 
 
 
220 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.28 
 
 
255 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.64 
 
 
234 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.63 
 
 
222 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.18 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  43.18 
 
 
229 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  48.95 
 
 
218 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.93 
 
 
211 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.15 
 
 
218 aa  178  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>