More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4621 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4621  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  81.3 
 
 
231 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
219 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.07 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  50.94 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.77 
 
 
219 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.24 
 
 
220 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  49.52 
 
 
220 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.51 
 
 
226 aa  205  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  50.48 
 
 
215 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.76 
 
 
212 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.66 
 
 
210 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  48.8 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  54.3 
 
 
218 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
212 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.75 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  52.75 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.75 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.75 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.75 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.75 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.06 
 
 
222 aa  198  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  47.37 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.09 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.59 
 
 
216 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.7 
 
 
240 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.7 
 
 
240 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.7 
 
 
240 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.7 
 
 
240 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.7 
 
 
240 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  46.23 
 
 
236 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.37 
 
 
215 aa  191  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  45.5 
 
 
221 aa  191  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 
240 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.04 
 
 
213 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  52.49 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.49 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.93 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.93 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.11 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.75 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.67 
 
 
214 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.22 
 
 
213 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.87 
 
 
222 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.83 
 
 
217 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.6 
 
 
213 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.11 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.67 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  43.72 
 
 
255 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.5 
 
 
217 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.47 
 
 
227 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1077  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  43.12 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135615  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47 
 
 
223 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.2 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.2 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.73 
 
 
229 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.4 
 
 
227 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  43.2 
 
 
218 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.85 
 
 
223 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  45.1 
 
 
217 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.23 
 
 
219 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  40.64 
 
 
229 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  41.82 
 
 
234 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  43.69 
 
 
218 aa  175  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.51 
 
 
217 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  46.23 
 
 
255 aa  174  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.23 
 
 
218 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  40.78 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  41.75 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  42.23 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  42.23 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.04 
 
 
222 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  41.75 
 
 
221 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.12 
 
 
215 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.05 
 
 
268 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  40.45 
 
 
229 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  41.89 
 
 
229 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  41.26 
 
 
218 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  41.94 
 
 
218 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  43.96 
 
 
222 aa  167  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  41.26 
 
 
218 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  44.34 
 
 
221 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  41.94 
 
 
217 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.61 
 
 
228 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  41.26 
 
 
219 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  41.26 
 
 
220 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.04 
 
 
221 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  38.68 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  40.69 
 
 
221 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>