More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1119 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1119  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3668  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  66.35 
 
 
215 aa  292  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.611031  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0832  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67 
 
 
220 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
220 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.931642  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2065  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
220 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5586  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.37 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2253  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B protein  63.77 
 
 
220 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0867253  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3038  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.16 
 
 
226 aa  278  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4337  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.71 
 
 
212 aa  278  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3128  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.02 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3945  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.56 
 
 
215 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5112  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.02 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4476  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.02 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5018  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.02 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5747  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.02 
 
 
218 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0644  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.04 
 
 
219 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.397938  normal  0.0625276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3159  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.02 
 
 
218 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5287  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.53 
 
 
217 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3594  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.01 
 
 
213 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575523  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1870  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.52 
 
 
213 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3952  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit B  65.52 
 
 
213 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4434  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.09 
 
 
217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.08 
 
 
213 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4458  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.93 
 
 
219 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.327202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4313  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.05 
 
 
219 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268622  normal  0.768911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  63.55 
 
 
218 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1035  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  60.38 
 
 
213 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0055  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0047  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0068  3-oxoadipate CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0850445  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1554  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.964102  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0057  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.472547  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1201  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1484  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  62.56 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0866  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
214 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.78885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5290  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.53 
 
 
213 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3549  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.72 
 
 
217 aa  267  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.427569  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 
229 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2872  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 
217 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1230  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.77 
 
 
213 aa  264  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000363739  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1503  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.59 
 
 
220 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1261  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.77 
 
 
221 aa  259  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4339  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.06 
 
 
210 aa  257  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.13 
 
 
222 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3709  3-oxoadipate CoA-transferase  53.59 
 
 
236 aa  254  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1112  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.65 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5060  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit beta  59.5 
 
 
233 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00134827  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4595  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.7 
 
 
223 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.21 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3847  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
227 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4071  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.67 
 
 
231 aa  241  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1845  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
218 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0820994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5093  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
227 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1015  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.19 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4402  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.84 
 
 
227 aa  237  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377192  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0637  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  54.85 
 
 
229 aa  235  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3592  3-oxoadipate CoA-transferase, beta subunit  50 
 
 
255 aa  234  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6118  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  55.34 
 
 
229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5021  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
223 aa  234  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.446414  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0621  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.29 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3719  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.34 
 
 
229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.269738  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5884  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.44 
 
 
229 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4026  3-oxoadipate CoA-transferase  56.35 
 
 
231 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0685667  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1731  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.35 
 
 
240 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0525  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.35 
 
 
240 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1681  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.35 
 
 
240 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0814197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1747  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.35 
 
 
240 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558517  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1703  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.35 
 
 
240 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6798  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.95 
 
 
234 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0565  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.86 
 
 
240 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.11 
 
 
211 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.45 
 
 
215 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.9 
 
 
255 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.95 
 
 
222 aa  221  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.9 
 
 
209 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4621  3-oxoadipate CoA-transferase  53.3 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.45 
 
 
228 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  52.74 
 
 
218 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.74 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.05 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.23 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.57 
 
 
213 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.77 
 
 
217 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
215 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  50.48 
 
 
209 aa  208  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  49.5 
 
 
218 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.5 
 
 
221 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  49.5 
 
 
218 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49 
 
 
218 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.78 
 
 
229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.78 
 
 
229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  49.52 
 
 
209 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
212 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
210 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1077  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  52.66 
 
 
226 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135615  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.78 
 
 
229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>