66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2155 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  56.6 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  55.17 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  56.06 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  53.26 
 
 
263 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  52.9 
 
 
264 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  44.49 
 
 
255 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  40.71 
 
 
252 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  42.53 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  42.69 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  42.58 
 
 
254 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  41.57 
 
 
286 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  41.5 
 
 
243 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  42.17 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  41.11 
 
 
249 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  39.69 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  39.69 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  39.69 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  39.53 
 
 
248 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  40 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  39.04 
 
 
250 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  31.89 
 
 
259 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  30.28 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  30.3 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.55 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  29.92 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  29.55 
 
 
259 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.55 
 
 
259 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  29.46 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  28.21 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.3 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
251 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  29.37 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  31.98 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  27.8 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  31.52 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  28.47 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  29.8 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  26.55 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  26.42 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  28.46 
 
 
251 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  28.72 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  24.72 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  24.72 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  26.59 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  32.65 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  24.52 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  24.14 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.17 
 
 
599 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  25.4 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  25.1 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  26.19 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  25.1 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  27.78 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  24.12 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  27.17 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.21 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  23.95 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  29.87 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  26.62 
 
 
590 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  25.19 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  28.32 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  28.34 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  24.43 
 
 
239 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  28.09 
 
 
250 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  27.81 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>