63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1077 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  91.2 
 
 		 250 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  88 
 
 		 250 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  67.33 
 
 		 255 aa  318  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  65 
 
 		 255 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  66.53 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  32.38 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  40.74 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  32.28 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  31.84 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  36.69 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  30.52 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  36.02 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  30.42 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  34.3 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  32.72 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  34.94 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  27.96 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  37.42 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  33.74 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  35.19 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  32.93 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  34.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  33.95 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  28.33 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  35.63 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  34.97 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  35.8 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  30.17 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  38.71 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.53 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  35.62 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  34.97 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  32.1 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  27.78 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  33.74 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  32.74 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  28.57 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  35.15 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  29.65 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  31.06 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  28.33 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  25.57 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  26.59 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  29.83 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  31.52 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  35.06 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  30.46 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  28.74 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.01 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.24 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  30.95 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  26.58 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  31.55 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  21.95 
 
 		 599 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  28.09 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  30.56 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  26.82 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  28.21 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  27.75 
 
 		 265 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>