77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4843 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 286 aa  583  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  89.09 
 
 		 275 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  47.79 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  36.55 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  36 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  38.15 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  35.5 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  33.07 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  33.84 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  34.39 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  32.4 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  35.22 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  31.6 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  34.13 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.4 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  31.33 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.28 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  30.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  30.52 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  33.88 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  33.61 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  30.04 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  30.23 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  26.15 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  31.35 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  30.3 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  27.6 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  38.27 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  29.02 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  31.73 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  29.07 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  31.62 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  29.67 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  28.24 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  28.29 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  26.56 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  34.57 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  25.28 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.04 
 
 		 590 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  27.78 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  32.22 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  29.78 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  23.08 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  28.46 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  28.57 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  31.48 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.46 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  28.74 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  32.82 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  33.33 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  24.52 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  30.23 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  28.79 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  30.97 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  33.33 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  33.33 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  32.16 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  27.24 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  29.26 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  25.19 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  26.28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  29.49 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  29.49 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  29.49 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  24.73 
 
 		 599 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.39 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  25.19 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  31.61 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.13 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.54 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  28.39 
 
 		 524 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.85 
 
 		 447 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.66 
 
 		 223 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>