158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2824 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  64.43 
 
 
260 aa  344  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  63.64 
 
 
260 aa  344  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  63.64 
 
 
260 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  63.6 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  61.42 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  62.8 
 
 
259 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  61.6 
 
 
259 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  59.85 
 
 
277 aa  329  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  56.57 
 
 
269 aa  308  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  60.16 
 
 
259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  57.44 
 
 
251 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  57.03 
 
 
253 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  56.45 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  56.61 
 
 
251 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  56.9 
 
 
251 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  47.3 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  35.51 
 
 
291 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  37.89 
 
 
261 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  34.66 
 
 
270 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  33.6 
 
 
264 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  33.06 
 
 
271 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  33.74 
 
 
275 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  34.82 
 
 
260 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  32.93 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  32.81 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  32.52 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  32.52 
 
 
274 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  31.69 
 
 
269 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  32.79 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  32.94 
 
 
269 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  33.73 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  34.01 
 
 
257 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  29.62 
 
 
278 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.12 
 
 
590 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  31.05 
 
 
275 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  31.33 
 
 
286 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  31.4 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  31.84 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  28.57 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  27.82 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  29.24 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  30.84 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  28.31 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  33.95 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  27.24 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  29.5 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  28.89 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  29.22 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.45 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  33.95 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  26.17 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  26 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  32.21 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  25.69 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  31.48 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  27.04 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  27.04 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  27.04 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  25.4 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  28 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  25.7 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  25.4 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  25.81 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  25.1 
 
 
599 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  26.25 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  29.2 
 
 
667 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  28.96 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.29 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02904  glutaconate CoA transferase subunit B  50 
 
 
67 aa  58.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  26.56 
 
 
663 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  32.14 
 
 
673 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  24.68 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  31.82 
 
 
666 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.57 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  30.73 
 
 
557 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3730  glutaconate CoA-transferase subunit B  46.67 
 
 
71 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.53 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  32.47 
 
 
663 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.49 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  26.52 
 
 
547 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  26 
 
 
663 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.55 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
543 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  26.48 
 
 
542 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.79 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  26.25 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  31.43 
 
 
669 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  29.66 
 
 
650 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  27.56 
 
 
660 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.85 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.46 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.11 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  31.3 
 
 
553 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.32 
 
 
215 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  24.79 
 
 
554 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  32.77 
 
 
554 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>