142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2824 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  97.81 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  89.67 
 
 		 275 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  90.37 
 
 		 273 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  78.11 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  62.12 
 
 		 269 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  62.92 
 
 		 271 aa  344  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  60.53 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  58.85 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  38.55 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  37.36 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  40.39 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  36.86 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  34.41 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  35.38 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  36.44 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  36.26 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  34.68 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  35.22 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  34.88 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  33.47 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  35.68 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  32.52 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  32.81 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  32.71 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  30 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  31.15 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  31.56 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  31.15 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  31.56 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  28.63 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  28.97 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  30.29 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.74 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  30.23 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  28.63 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  26.14 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  29.07 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  26.09 
 
 		 599 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  28.33 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  27.24 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  28.33 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  24.72 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  25.95 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  25.3 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  27.65 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  30 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  25.11 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  27.14 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  24.38 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.46 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.88 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  25.5 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  25.79 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  23.84 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  24.3 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  23.43 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  25.79 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.21 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.45 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.07 
 
 		 453 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  23.53 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.12 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  22.59 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  28.02 
 
 		 542 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.63 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  25.16 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  25.97 
 
 		 663 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  29.66 
 
 		 667 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.73 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.73 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.26 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.32 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  28.15 
 
 		 666 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  23.31 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.57 
 
 		 448 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  29.01 
 
 		 527 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  32.05 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  31.4 
 
 		 554 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.67 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  31.01 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  31.4 
 
 		 554 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  31.4 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>