69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1471 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  61.76 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30.69 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  31.13 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  30.24 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  32.54 
 
 		 250 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  37.31 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  31.74 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  30.77 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  33.82 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.69 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  28.12 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  28.78 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  30.52 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  30.92 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  27.85 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  31.05 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  32.05 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  30.13 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 599 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  32.05 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  31.41 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  33.33 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  24.31 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  28.86 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  31.19 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  32.58 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  28.89 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  28.24 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  29.05 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  30.61 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  31.01 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  28.19 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  29.5 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  28 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  30.77 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  28.57 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  29.56 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  24.9 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  32.35 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  28.17 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  25.73 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  23.77 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  25.79 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  25.6 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  26.55 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  26.81 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  28.39 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  24.02 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  25.81 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  21.88 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.04 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  24.43 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.7 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  26.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  26.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  26.39 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  26.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  28.7 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  26.88 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.26 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.24 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>