145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1708 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  93.33 
 
 		 275 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  90.37 
 
 		 274 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  89.63 
 
 		 274 aa  507  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  79.85 
 
 		 274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  64.15 
 
 		 269 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  64.66 
 
 		 271 aa  348  8e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  61.65 
 
 		 270 aa  338  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  56.93 
 
 		 269 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  39.69 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  38.08 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  39.29 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  36.51 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  36.74 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  37.2 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  36.6 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  35.29 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  33.6 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  32.8 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  32.93 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  34.68 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  31.94 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  34.13 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  32 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  34.78 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  32.8 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  31.6 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  33.59 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  32 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  34.85 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  28.24 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  29.76 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  30.11 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  27.17 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  31.76 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  26.07 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  28.21 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  27.96 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  26.42 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  25.72 
 
 		 599 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  28.29 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  24.31 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  28.68 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  26.72 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  25.31 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  27.17 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.02 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  25.97 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  25.3 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.59 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  29.71 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  27.43 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  27.73 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  25.44 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  26.59 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  27.51 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  26.56 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  24.21 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.67 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  24.46 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  25.64 
 
 		 590 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  25.19 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  24.03 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.47 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.93 
 
 		 453 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.22 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  28.99 
 
 		 542 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.8 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  31.29 
 
 		 667 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  27.32 
 
 		 663 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  25.48 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  26.07 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.11 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  26.8 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.32 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  27.5 
 
 		 554 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  30.53 
 
 		 527 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  28.15 
 
 		 666 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.9 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.93 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.36 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  24.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  25.21 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.84 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  27.32 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.99 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  30.22 
 
 		 669 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  32.31 
 
 		 646 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3730  glutaconate CoA-transferase subunit B  32.86 
 
 		 71 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.83 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>