67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1433 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  100 
 
 
265 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  73.21 
 
 
266 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  59.16 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  55.17 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  58.02 
 
 
265 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  58.3 
 
 
264 aa  292  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  43.3 
 
 
252 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  42.31 
 
 
255 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  45.93 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  47.18 
 
 
243 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  46.37 
 
 
243 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  43.9 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  41.8 
 
 
250 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  42.45 
 
 
256 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  41.04 
 
 
254 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  40.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  40.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  40.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  40 
 
 
248 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  39.61 
 
 
249 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  38.98 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  32.58 
 
 
259 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  32.3 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.83 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  30.45 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  30.36 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  30.08 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  30.94 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  29.25 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  31.75 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  32.54 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  31.1 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  30.57 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.32 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  27 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  30.83 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  26.86 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  30.83 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  29.62 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  29.63 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  28.74 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  29.55 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  31.71 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  26.05 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  25.38 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  25.81 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  25.76 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  26.25 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  25.19 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  24.9 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  29.76 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.73 
 
 
590 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  27.73 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  26.91 
 
 
599 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  27.17 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  23.53 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  28.31 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  23.62 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  23.53 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  22.96 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02904  glutaconate CoA transferase subunit B  44.68 
 
 
67 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30.41 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  28.32 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  26.88 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  26.79 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  27.75 
 
 
250 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>