91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4620 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  63.71 
 
 
286 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  60.41 
 
 
243 aa  287  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  59.2 
 
 
252 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  57.49 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  56.73 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  53.33 
 
 
254 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  56.52 
 
 
247 aa  258  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  51.76 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  51.76 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  51.76 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  56.5 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  52.63 
 
 
250 aa  251  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  51.61 
 
 
248 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  51.43 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  44.49 
 
 
276 aa  215  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  43.14 
 
 
266 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  42.31 
 
 
265 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  43.89 
 
 
263 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  43.2 
 
 
265 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  46.47 
 
 
264 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  28.92 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  30.83 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  31.58 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  33.07 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  28.79 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  36.84 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  39.58 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  28.79 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.45 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  31.88 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  33.87 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  35.37 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  28.41 
 
 
259 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  31.12 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  28.74 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  29.2 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  30.33 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  28.06 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  30.33 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  32.93 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  32.93 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  29.92 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  29.78 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  29.22 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  27.88 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  28.39 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  31.95 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.77 
 
 
599 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  30.38 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  28.19 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  31.71 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.3 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  32.14 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  29.84 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  26.16 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  28.21 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  29.88 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  26.95 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  27.13 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  28.66 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  26.47 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  26.21 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  26.83 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  26.21 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  28.66 
 
 
274 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30 
 
 
590 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  25.86 
 
 
269 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  26.22 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.19 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.48 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.48 
 
 
218 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  31.13 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  29.36 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  31.13 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.7 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.81 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  30.77 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  46.94 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  42.31 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.81 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.49 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  29.81 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.81 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  45.31 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.49 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.49 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  30.77 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  40 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  29.81 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>