78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4812 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  89.09 
 
 		 286 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  47.43 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  38.4 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  36.18 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  35.97 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  34.68 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  34.54 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  33.46 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  33.86 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  32 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  34.82 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  34.66 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  31.73 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  31.2 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.4 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  31.05 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  30.52 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.28 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  34.43 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  30.86 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  40.74 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  32.94 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  30 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  31.75 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  30.49 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  30.92 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  26.54 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  29.46 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.64 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  29.07 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  27.6 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  35.8 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  27.91 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  25.49 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  35.19 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  27.34 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  27.45 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 590 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  25.09 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.38 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  29.62 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  34.73 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  27.67 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  23.85 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  29.65 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  34.04 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  31.09 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  28.35 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  27.88 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  24.14 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  29.84 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  30.26 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  26.67 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  27.4 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  32.27 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  25.19 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  27.41 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  27.59 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  23.91 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  29.81 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  29.83 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  29.83 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  29.83 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  24.23 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.72 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.63 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.17 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  26.89 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  27.03 
 
 		 669 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  29.22 
 
 		 448 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.45 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>