105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1132 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  36.76 
 
 
291 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  40 
 
 
269 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  39.43 
 
 
251 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  39.85 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  37.79 
 
 
275 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  36.6 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  36.7 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  37.3 
 
 
259 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  37.1 
 
 
261 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  38.37 
 
 
271 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  37.04 
 
 
269 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  36.26 
 
 
274 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  40.15 
 
 
271 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  35.88 
 
 
274 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  35.66 
 
 
253 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  37.4 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  34.82 
 
 
256 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.47 
 
 
269 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  34.38 
 
 
277 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  33.61 
 
 
259 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  33.6 
 
 
260 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  35.37 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  32.93 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  35.52 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  35.52 
 
 
281 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  31.98 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  33.61 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  31.98 
 
 
260 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  31.2 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  30.77 
 
 
256 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  31.25 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  28.91 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  28.57 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  30.77 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  31.49 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  29.92 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  28.89 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  29.05 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  29.83 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.72 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  29.83 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  28.24 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  27.27 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  28.22 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  28.76 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  26.86 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  29.52 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  26.32 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  33.12 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  25.64 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  26.48 
 
 
590 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  27.13 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  25.4 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  27.16 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  27.16 
 
 
248 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  25.56 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  27.71 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  27.71 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  27.71 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.51 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  30.06 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3730  glutaconate CoA-transferase subunit B  40 
 
 
71 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  28.28 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  25.53 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  27.11 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.11 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  25.91 
 
 
554 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.24 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  29.14 
 
 
524 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.4 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.68 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.11 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.4 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  30.13 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  25.21 
 
 
506 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  22.88 
 
 
599 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  26.91 
 
 
553 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  28.39 
 
 
511 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  23.5 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  28.31 
 
 
448 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  27.52 
 
 
218 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  27.24 
 
 
554 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  24.36 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  24.26 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  22.88 
 
 
217 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  23.4 
 
 
218 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  30.62 
 
 
522 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.17 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.02 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  27.78 
 
 
667 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  23.78 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  28.38 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.24 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  24.71 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.04 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  28.35 
 
 
547 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>