65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5133 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  72.98 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  66.67 
 
 		 250 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  65 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  63.29 
 
 		 250 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  65.98 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  32.92 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  38.32 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  36.2 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  28.92 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  31.07 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  27.85 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  34.84 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  28.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  32.93 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  32.2 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  26.46 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.92 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30.16 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  30.52 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  35.76 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  33.55 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  33.55 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  34.42 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  30.13 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  32.47 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  31.17 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  29.31 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  28.57 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  33.54 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  31.48 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  30.06 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.87 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  27.57 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  29.85 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  34.04 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  33.77 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  27.43 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  28.25 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  29.27 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  28.92 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  28.05 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  30.67 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  29.53 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  31.55 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  26.36 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  26.88 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  26.83 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  30.99 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  27.71 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.83 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  28.99 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  28.82 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  30.52 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  29.61 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  29.61 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  29.61 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.66 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  28.57 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  27.88 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  23.11 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  29.32 
 
 		 663 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>