76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3035 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 321 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  88.47 
 
 		 321 aa  597  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  91.8 
 
 		 320 aa  594  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  92.11 
 
 		 320 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  74.14 
 
 		 325 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  59.69 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  55.11 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  53.56 
 
 		 325 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  31.68 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  32.82 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.29 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.89 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.23 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  28.22 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  29.07 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  28.37 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.66 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  30.61 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  27.91 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  30.88 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.59 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  30.61 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  28.62 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  28.62 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.64 
 
 		 599 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  27 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  30.25 
 
 		 265 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  28.42 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  32.14 
 
 		 271 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.57 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  31.14 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  27.52 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.79 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  29.46 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  26.28 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.56 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  26.64 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  25.81 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  27.73 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  27.76 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.29 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  24.92 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  26.16 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  25.18 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  26.76 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  24.48 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  26.73 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  25 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  26.89 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  24.09 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  21.67 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  23.18 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  22.26 
 
 		 280 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  21.99 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  23.51 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  23.45 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  22.76 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  23.31 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  22.69 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  23.21 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  23.79 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  22.07 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  22.07 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  25.31 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  21.72 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  26.39 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.68 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  24.6 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.81 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.26 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.31 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.83 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>