72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2825 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  100 
 
 		 320 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  98.75 
 
 		 320 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  91.54 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  92.11 
 
 		 321 aa  594  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  73.98 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  58.88 
 
 		 326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  55.49 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  52.35 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  32.88 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  31.41 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.46 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.44 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  28.52 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  28.98 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.21 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  29.86 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  28.22 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  30.2 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  28.86 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  28.97 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  30.82 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  27.02 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  28.77 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  27.24 
 
 		 599 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.61 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 271 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  28.78 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.35 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.06 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  31.93 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.7 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  31.21 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.37 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  28.09 
 
 		 276 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  31.88 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.62 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.86 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.33 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  26.83 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  25.59 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  27.84 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  26.72 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  24.33 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.17 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  24.75 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  23.33 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  27.72 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  22.92 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  25.74 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.98 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  26.15 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  23.84 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  28.15 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  24.17 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  23.51 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  23.13 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  26.15 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  23.92 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  23.45 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  22.19 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  22.19 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  24.33 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  21.85 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  24.91 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  23.93 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  25.59 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2918  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000077275 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  27.36 
 
 		 461 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.91 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>