212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2126 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  100 
 
 
313 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  35.12 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  35.21 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  37.87 
 
 
297 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.1 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  35.62 
 
 
251 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  35.37 
 
 
329 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  32.3 
 
 
332 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.04 
 
 
305 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  34.34 
 
 
305 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  33.71 
 
 
271 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  31.53 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.02 
 
 
276 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31.56 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.36 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  31.89 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  32.68 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  27.92 
 
 
599 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.84 
 
 
276 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  31.01 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  29.15 
 
 
300 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  32.49 
 
 
304 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  31.33 
 
 
271 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  32.04 
 
 
283 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  30.45 
 
 
326 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.67 
 
 
283 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.45 
 
 
286 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  31.93 
 
 
285 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  31.93 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  30.63 
 
 
285 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29.57 
 
 
325 aa  99.8  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  30.12 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  31.65 
 
 
273 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.22 
 
 
269 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  32.71 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.62 
 
 
268 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  30.61 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  30.65 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.07 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.13 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  31.4 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  31.52 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  34.07 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  32.71 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  29.7 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  27.66 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  31.02 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  30.61 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  31.85 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  33.7 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  30.66 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  29.73 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  30.24 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.62 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30.8 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  29.2 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  28.71 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  25.87 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  29.61 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.4 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  29.37 
 
 
261 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.54 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.2 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  32.79 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.83 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.2 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.96 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.91 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.65 
 
 
238 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.61 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.33 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.03 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.13 
 
 
233 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.75 
 
 
235 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.88 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.22 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.7 
 
 
236 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.76 
 
 
235 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.76 
 
 
235 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0959  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.03 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248714  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.01 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.68 
 
 
245 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.48 
 
 
232 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.65 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.66 
 
 
234 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  25.73 
 
 
506 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.13 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.38 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.87 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  24.77 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 
255 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.68 
 
 
217 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.83 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07610  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.64 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>