277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5072 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  100 
 
 		 329 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  52.79 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  52.13 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  37.06 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.73 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  38.02 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.65 
 
 		 599 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.61 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  35.54 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  34.48 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  35.4 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.72 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  35.09 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  34.15 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  35.34 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  35.45 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.73 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  29.14 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  34.08 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  34.77 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.23 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  34.94 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  33.68 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  34.06 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  34.04 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  32.79 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  33.1 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  33.68 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  32.54 
 
 		 261 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  34.34 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.78 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  32.97 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.78 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  33.88 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  33.82 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.1 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29.04 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  32.99 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.52 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  31.48 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.89 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  29.89 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32.24 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  32.81 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.37 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.58 
 
 		 269 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  30.57 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.41 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  31.9 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.86 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  27.95 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  29.93 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  29.63 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.09 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  29.29 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.56 
 
 		 268 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  29.88 
 
 		 265 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  30.43 
 
 		 272 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  28.96 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  29.1 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  26.81 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  33.06 
 
 		 590 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30.43 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  27.33 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.64 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.59 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.42 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.14 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  30.61 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.86 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.74 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.14 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.19 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.52 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.61 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.93 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.26 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.05 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.51 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.51 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.9 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5001  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.15 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0462314  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.31 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.96 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.76 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  30.65 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.96 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>