201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13584 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  80.48 
 
 
295 aa  497  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  79.51 
 
 
296 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  78.82 
 
 
295 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  78.82 
 
 
295 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  78.47 
 
 
295 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  66.21 
 
 
297 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  59.93 
 
 
290 aa  342  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  60.29 
 
 
281 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  59.79 
 
 
289 aa  328  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  59.3 
 
 
280 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  57.48 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  57.54 
 
 
280 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  56.79 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  59.14 
 
 
261 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  49.1 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  49.12 
 
 
294 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  46.55 
 
 
296 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  46.53 
 
 
297 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  48.4 
 
 
293 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  41.9 
 
 
291 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  33.45 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.01 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.94 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  31.77 
 
 
276 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  26.52 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  29.15 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.89 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  29.12 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.12 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  29.61 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.99 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  27.27 
 
 
599 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  28.62 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  25 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  28.72 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  29.97 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  27.37 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.62 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  24.18 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.07 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  25.41 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  21.75 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  28.17 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  30.43 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.76 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.38 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  24.4 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  23.15 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.51 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  23.9 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.67 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  28.99 
 
 
271 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  27.82 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.97 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.53 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  35.94 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  29.57 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.76 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.33 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  25.72 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  28.63 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.95 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.71 
 
 
590 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.45 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.01 
 
 
238 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.25 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.31 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.73 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.81 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.35 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.1 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.1 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  23.88 
 
 
561 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.52 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.51 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.5 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.29 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  29.12 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  27.05 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.87 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.82 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0620  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.07 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.35 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.57 
 
 
221 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 
231 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.29 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.62 
 
 
263 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.77 
 
 
235 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.48 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  25.87 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.1 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.29 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.31 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.68 
 
 
232 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.31 
 
 
235 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 
221 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  25.86 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  23.68 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>