146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7928 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  75.19 
 
 		 273 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  75.56 
 
 		 271 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  74.34 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  73.95 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  69.06 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  68.52 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  75.94 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  68.68 
 
 		 285 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  69.81 
 
 		 283 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  71.15 
 
 		 276 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  69.43 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  65.93 
 
 		 289 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  62.41 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  61.9 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  61.42 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  53.45 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  37.69 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  35.21 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  38.53 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.21 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.89 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.88 
 
 		 599 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  33.79 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  27.97 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.7 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.75 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.65 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  26.41 
 
 		 326 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.77 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.46 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  26.62 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.32 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.04 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  32.06 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.15 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  32.06 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  28.98 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.45 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.86 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.28 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.78 
 
 		 590 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  27.31 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  30.28 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  30.83 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.12 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  28.87 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.47 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.34 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  29.92 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.21 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  28.78 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  29.41 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  27.9 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  28.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  27.92 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  28.21 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  28.67 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  28.67 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  28.32 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  27.82 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  30.38 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.7 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.67 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  23.87 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  29.55 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.11 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.86 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.83 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.96 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.39 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  28 
 
 		 461 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.43 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.39 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  25.66 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.11 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.7 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.94 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.61 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.24 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.78 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.97 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  30.26 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.35 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.28 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3946  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.51 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.55 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.99 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>