More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2072 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  54.79 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  56.95 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  56.01 
 
 		 297 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  57.04 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  55.6 
 
 		 280 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  57.61 
 
 		 289 aa  311  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  56.31 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  53.99 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  55.16 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  54.15 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  54.12 
 
 		 293 aa  294  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  57.6 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  49.32 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  48.94 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  47.89 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  48.24 
 
 		 295 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  48.24 
 
 		 295 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  48.24 
 
 		 295 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  49.12 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  48.07 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.69 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  36.99 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  36.88 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  34.98 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  33.33 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  31.64 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.06 
 
 		 599 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  31.97 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  30.12 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.6 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  26.97 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.35 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  26.09 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  26.97 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.81 
 
 		 590 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.88 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.12 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.96 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.32 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  26.89 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  31.75 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.41 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.31 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.33 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.12 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  22.34 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  27.8 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.05 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  28.62 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.12 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.45 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.85 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.03 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2803  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.7 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  30.16 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  30.35 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31.4 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.84 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.16 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  30.24 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.24 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.39 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.21 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  30.24 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  30.24 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.03 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.9 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.37 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.21 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.7 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  29.38 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.41 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.78 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.85 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.35 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.17 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  33 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1453  3-oxoacid CoA-transferase  29.21 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00126643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.65 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  29.76 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  29.76 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.46 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  24.47 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.2 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.15 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.21 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.29 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.84 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.37 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>