97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2823 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  63.64 
 
 
285 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  64.56 
 
 
283 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  67.29 
 
 
285 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  63.16 
 
 
289 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  63.51 
 
 
285 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  62.81 
 
 
283 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  63.57 
 
 
271 aa  360  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  65.06 
 
 
273 aa  359  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  64.04 
 
 
271 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  60 
 
 
295 aa  349  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  61.42 
 
 
273 aa  343  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  60.58 
 
 
276 aa  340  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  60 
 
 
273 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  62.77 
 
 
286 aa  334  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  61.45 
 
 
265 aa  328  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  43.97 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  35.46 
 
 
297 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
305 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  34.3 
 
 
305 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 
317 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.74 
 
 
329 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.58 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.67 
 
 
599 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.4 
 
 
313 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.62 
 
 
291 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  30.47 
 
 
276 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  29.57 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.53 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.22 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  30.77 
 
 
298 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  27.03 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  26.95 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  27.14 
 
 
289 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  27.67 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  27.67 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  28.09 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.85 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.6 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30.33 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.09 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.58 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.61 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  26.3 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  28.46 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  29.11 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  26.2 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.94 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  26.72 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  28.09 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  27 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.79 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  28.03 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  27.97 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  26.67 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  26.88 
 
 
590 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  27.48 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  28.15 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  27.81 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  24.89 
 
 
300 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  26.89 
 
 
321 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  24.24 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  29.63 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  27.13 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  24.23 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.36 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  23.89 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.86 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  22.87 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  22.87 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.1 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.76 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.58 
 
 
235 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.91 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.75 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  24.7 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.85 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.45 
 
 
229 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.09 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.59 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.74 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.9 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  25.77 
 
 
233 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.15 
 
 
463 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.82 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  23.38 
 
 
561 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2349  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.29 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.991944  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  25.35 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.37 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.29 
 
 
236 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.26 
 
 
233 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.5 
 
 
234 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>