83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1906 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  100 
 
 
325 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  58.9 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  55.11 
 
 
325 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  55.11 
 
 
322 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  53.56 
 
 
321 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  52.01 
 
 
321 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  52.35 
 
 
320 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  52.35 
 
 
320 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.14 
 
 
304 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  29.93 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  28.13 
 
 
332 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  28.1 
 
 
305 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  31.92 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  28.85 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31.36 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  28.3 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  30.9 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.82 
 
 
285 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  30.07 
 
 
285 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  27.96 
 
 
599 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.7 
 
 
283 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  29.57 
 
 
295 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  28.52 
 
 
271 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.04 
 
 
283 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.12 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  23.72 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  27.93 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  27.95 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  30.18 
 
 
276 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  26.62 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  30.53 
 
 
271 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.99 
 
 
273 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  25.59 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  25.18 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  28.2 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  26.21 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  28.38 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  23.59 
 
 
296 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  28.02 
 
 
251 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29.48 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  26.16 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  24.91 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  25.51 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  21.92 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  23.26 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  25.82 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  22.34 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  23.94 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.52 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  25.1 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  25.49 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  24.31 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  23.24 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  24.41 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  27.67 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  26.85 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  25.09 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  25.28 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  23.08 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  21.75 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  22.6 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  22.26 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  22.26 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  25.09 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  23.73 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  24.13 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  24.59 
 
 
272 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.69 
 
 
448 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  22.48 
 
 
297 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.9 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.35 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  22.67 
 
 
218 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.9 
 
 
463 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.03 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  21.79 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.09 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.2 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.74 
 
 
237 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.21 
 
 
239 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  21.88 
 
 
235 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25 
 
 
234 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.73 
 
 
274 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.19 
 
 
235 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>