More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2064 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  72.4 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  72.4 
 
 
280 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  69.89 
 
 
289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  67.03 
 
 
290 aa  394  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  67.74 
 
 
293 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  61.79 
 
 
281 aa  361  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  68.25 
 
 
261 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  58.08 
 
 
295 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  56.9 
 
 
295 aa  322  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  56.9 
 
 
295 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  56.9 
 
 
295 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  57.49 
 
 
296 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  56.88 
 
 
298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  56.79 
 
 
292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  53.99 
 
 
294 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  55.63 
 
 
297 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  54.48 
 
 
296 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  55.87 
 
 
297 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  53.68 
 
 
293 aa  271  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  49.46 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.81 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  34.81 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  32.8 
 
 
268 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.45 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  33.61 
 
 
251 aa  119  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30.42 
 
 
300 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.33 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.64 
 
 
599 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.46 
 
 
302 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.66 
 
 
285 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  28.8 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.97 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  34.08 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.62 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  28.83 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  33.15 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  34.51 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32.35 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.58 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.04 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.66 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  25.35 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.66 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  28.2 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  26.1 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.51 
 
 
325 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  30.28 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  27.17 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  27.5 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.04 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.28 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.83 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  27.11 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  24.63 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.06 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  25.59 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  28.92 
 
 
590 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  29.67 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.67 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  29.67 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  29.67 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.35 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  32.49 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  23.7 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  29.67 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  24.63 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.86 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  29.19 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.46 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  23.88 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.23 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.87 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.35 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.35 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2105  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.37 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.897892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.98 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.6 
 
 
229 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.56 
 
 
219 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.24 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1702  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  31.4 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.125286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.07 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.41 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.57 
 
 
453 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.87 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.14 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.9 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  24.16 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.58 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.41 
 
 
232 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.802929  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.9 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.9 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>