More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2744 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  100 
 
 		 293 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  66.43 
 
 		 290 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  67.74 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  66.67 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  67.99 
 
 		 289 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  66.31 
 
 		 280 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  66.01 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  59.73 
 
 		 295 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  59.73 
 
 		 295 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  59.73 
 
 		 295 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  59.04 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  59.04 
 
 		 296 aa  329  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  58.87 
 
 		 281 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  57.48 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  56.67 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  58.18 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  54.12 
 
 		 294 aa  294  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  55.44 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  53.52 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  55.48 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  49.29 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.35 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.85 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  32.13 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  30.31 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.49 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  32.86 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.23 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.87 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  29.49 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.5 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  31.94 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  29.43 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  32.22 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  34.25 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  32.22 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  31.47 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.6 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.89 
 
 		 590 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  30.4 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  31.09 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  33.46 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  31.13 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  36.99 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.8 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  26.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.57 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.72 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.19 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  27.84 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  31.16 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  25.99 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.78 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.82 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.37 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  30.28 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.09 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.83 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  29.46 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.96 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.43 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.5 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.95 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  30.2 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  28.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.18 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.24 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  29.5 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.47 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  28.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  25.09 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.13 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.93 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.24 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.48 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.5 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1390  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.78 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.24 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.84 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.57 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.07 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  26.04 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.37 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.35 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.78 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  28.05 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.83 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>