293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2058 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  70.97 
 
 
251 aa  360  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.07 
 
 
276 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  35.12 
 
 
313 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  32.68 
 
 
305 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.66 
 
 
305 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.58 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.29 
 
 
599 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  31.01 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  32.8 
 
 
286 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  34.82 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  33.86 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  31.23 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  34.08 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  28.46 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  33.73 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  29.13 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.3 
 
 
325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  30.5 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.64 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  29.64 
 
 
297 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  31.68 
 
 
290 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  34.63 
 
 
271 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  29.72 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  32.69 
 
 
268 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  29.85 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  30.4 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  31.17 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.16 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.91 
 
 
297 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  30.12 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  31.08 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  32.13 
 
 
293 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  29.48 
 
 
295 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  33.98 
 
 
293 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.48 
 
 
272 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  31.91 
 
 
285 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  31.4 
 
 
321 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.97 
 
 
283 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  29.46 
 
 
272 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  34.17 
 
 
272 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.97 
 
 
283 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  31.54 
 
 
320 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  30.74 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  29.34 
 
 
321 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.33 
 
 
285 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.38 
 
 
320 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  29.85 
 
 
295 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  29.66 
 
 
295 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.08 
 
 
273 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  29.92 
 
 
271 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.92 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  30 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  34.17 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  28.74 
 
 
300 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.74 
 
 
286 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  28.73 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  30.29 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  29.63 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  27.92 
 
 
297 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  29.53 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  26.52 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.05 
 
 
299 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  30.65 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  29.06 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.3 
 
 
590 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.55 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  30.22 
 
 
448 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.92 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.3 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.08 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.57 
 
 
453 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.7 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.76 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.28 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.18 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.91 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  25.84 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.94 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.61 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0638  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.44 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.5 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.89 
 
 
233 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.27 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.23 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.67 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5561  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.53 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.670135  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  28.29 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  29.76 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.44 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.45 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.06 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.04 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>