More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1558 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  75.25 
 
 
297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  63.95 
 
 
298 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  62.37 
 
 
293 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  56.95 
 
 
294 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  55.14 
 
 
291 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  55.16 
 
 
281 aa  299  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  53.43 
 
 
290 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  54.48 
 
 
286 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  60.4 
 
 
261 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  55.68 
 
 
280 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  56.04 
 
 
280 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  56.25 
 
 
289 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  53.52 
 
 
293 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  47.77 
 
 
297 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  46.55 
 
 
292 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  46.98 
 
 
295 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  46.98 
 
 
295 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  46.62 
 
 
295 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  46.26 
 
 
295 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  45.55 
 
 
296 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.11 
 
 
305 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  36.21 
 
 
329 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.17 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  35.6 
 
 
276 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.26 
 
 
599 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.73 
 
 
276 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  34.24 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.5 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  33.22 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.27 
 
 
251 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  31.38 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  27.83 
 
 
326 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  30.15 
 
 
297 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.52 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  31.58 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  23.59 
 
 
325 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.01 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  29.2 
 
 
332 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.74 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  27.39 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.2 
 
 
269 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  34.58 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  30.66 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  30.63 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
590 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  31.02 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.93 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.32 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.62 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  27.65 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  34.88 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.23 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  27 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.32 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.51 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.47 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.19 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.13 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  29.41 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  26.83 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  28.09 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  28.67 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  26.92 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  29.89 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.98 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  26.48 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.9 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  26.16 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.92 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.93 
 
 
245 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.59 
 
 
218 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  27.94 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.59 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1140  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.93 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.373341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.41 
 
 
235 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.14 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.96 
 
 
463 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.43 
 
 
245 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2105  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.63 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.897892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  26.55 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.1 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.92 
 
 
233 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  27.14 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.26 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.26 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  30.2 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.79 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.92 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3823  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.35 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.89 
 
 
235 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3295  putative CoA transferase, subunit A  30.56 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  27.88 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4701  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.4 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196334  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.97 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38660  putative CoA transferase, subunit A  30.56 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>